学校办学历史源远流长,系厦门市教育发源地。2006年10月27日是学校的百年华诞。厦门五中起源于明、清时期的义学和玉屏书院,1906年改称厦门中学堂。学校先后易名为思明中学、省立十三中学、省立厦门中学。解放后,人民政府接管学校,省中、市中合并为厦门第一中学。随着人民教育事业的迅速发展,1955年秋,将厦门一中师生一分为二,在玉屏书院原址定名为厦门第五中学至今。改革开放以来,厦门五中坚持“以人为本,以质取胜”的办学理念,积极开展以课堂教学改革为中心、以丰富多彩的课外科技、体育、艺术等活动为载体的素质教育活动,努力使不同层次的同学都能在原有的基础上得到提高,努力使不同专长的同学都能得到全面发展。学校围绕“弘扬中华美德,构建和谐学校”这一主题,扎实地开展学校德育工作。同时建立以“学校、家庭、社会”三结合的教育网络,发挥共建共育的优势,推进“绿洲工程”。积极开展教师培训、进修、听课、讲座、交流等模式的继续教育活动,建设一支师德良好、知识扎实、严谨治学、谦虚进取的高素质教师队伍。教育教学质量优良,办学成绩斐然,赢得社会各界的赞赏。